Systém pro prostorově rozlišenou transkriptomiku s vysokým rozlišením

Krátký popis

Jedná se o dodávku systému pro prostorově rozlišenou transkriptomiku s vysokým rozlišením, který umožňuje detekci mRNA transkriptů pro vybraný panel genů při prostorovém rozlišení na jednobuněčné nebo dokonce molekulární úrovni, a to jak v řezech z parafínových bločků, tak z čerstvě zmražených histologických preparátů. Tímto způsobem systém kvantifikuje expresní aktivitu vybraných genů a zároveň zachycuje pozice jejich transkriptů v buňce. Po vlastní IB-SRT analýze je na vzorku možné provádět fluorescenční mikroskopii a barvení hematoxylinem a eosinem (H&E), popřípadě prostorovou transkriptomiku s nízkým rozlišením (sequencing-based spatially resolved transcriptomics, SB-SRT). Systém tak umožňuje analýzu transkripčního profilu buněk v prostorovém kontextu a jeho přímé spřažení s buněčným fenotypem. Systém zahrnuje výpočetní a softwarové řešení, které provádí zpracování obrazové informace, segmentaci buněk, kvantitativní vyhodnocení a vizualizaci dat. Výstupy z tohoto zpracování jsou dostupné v otevřených formátech pro vizualizaci a další analýzy. Systém dále zahrnuje potřebná doplňková zařízení jako je přístroj na přenos vzorků pro následné analýzy (SB-SRT), antivibrační stůl a další příslušenství nutné k provádění experimentů.
Systém musí být dodán s veškerým nezbytným příslušenstvím do místa plnění, včetně jeho instalace v místě plnění a zaškolení pověřených zaměstnanců Zadavatele v českém nebo anglickém jazyce, a to na náklady vybraného dodavatele.

Popis veřejné zakázky

Jedná se o dodávku systému pro prostorově rozlišenou transkriptomiku s vysokým rozlišením, který umožňuje detekci mRNA transkriptů pro vybraný panel genů při prostorovém rozlišení na jednobuněčné nebo dokonce molekulární úrovni, a to jak v řezech z parafínových bločků, tak z čerstvě zmražených histologických preparátů. Tímto způsobem systém kvantifikuje expresní aktivitu vybraných genů a zároveň zachycuje pozice jejich transkriptů v buňce. Po vlastní IB-SRT analýze je na vzorku možné provádět fluorescenční mikroskopii a barvení hematoxylinem a eosinem (H&E), popřípadě prostorovou transkriptomiku s nízkým rozlišením (sequencing-based spatially resolved transcriptomics, SB-SRT). Systém tak umožňuje analýzu transkripčního profilu buněk v prostorovém kontextu a jeho přímé spřažení s buněčným fenotypem. Systém zahrnuje výpočetní a softwarové řešení, které provádí zpracování obrazové informace, segmentaci buněk, kvantitativní vyhodnocení a vizualizaci dat. Výstupy z tohoto zpracování jsou dostupné v otevřených formátech pro vizualizaci a další analýzy. Systém dále zahrnuje potřebná doplňková zařízení jako je přístroj na přenos vzorků pro následné analýzy (SB-SRT), antivibrační stůl a další příslušenství nutné k provádění experimentů.
Systém musí být dodán s veškerým nezbytným příslušenstvím do místa plnění, včetně jeho instalace v místě plnění a zaškolení pověřených zaměstnanců Zadavatele v českém nebo anglickém jazyce, a to na náklady vybraného dodavatele.

Přesné informace o lhůtě (lhůtách) pro přezkumné řízení

Podmínkou pro podání návrhu k ÚOHS je podání námitek k Zadavateli, které je nutné doručit do 15 dnů ode dne, kdy se stěžovatel dozvěděl o domnělém porušení zákona Zadavatelem, nejpozději však do uzavření smlouvy nebo do chvíle, kdy se soutěž o návrh považuje po výběru návrhu za ukončenou.

Námitky proti úkonům oznamovaným v dokumentech, které je Zadavatel povinen podle zákona uveřejnit či odeslat stěžovateli, musí být doručeny Zadavateli do 15 dnů od jejich uveřejnění či doručení stěžovateli.
Pokud je v zadávacím řízení stanovena lhůta pro podání žádostí o účast, musí být námitky proti podmínkám vztahujícím se ke kvalifikaci dodavatele doručeny Zadavateli nejpozději do skončení této lhůty.
Pokud je v zadávacím řízení stanovena lhůta pro podání nabídek, musí být námitky proti zadávacím podmínkám doručeny Zadavateli nejpozději do skončení této lhůty. Námitky proti obsahu výzvy k podání nabídek v dynamickém nákupním systému nebo při zadávání veřejné zakázky na základě rámcové dohody musí být zadavateli doručeny nejpozději do konce lhůty pro podání nabídek. V soutěži o návrh musí být námitky proti soutěžním podmínkám doručeny nejpozději do konce lhůty pro podání návrhů. Zadavatel může v zadávací dokumentaci nebo soutěžních podmínkách stanovit, že námitky podle § 242 odst. 3 nebo 4 zákona lze podat nejpozději 72 hodin před skončením lhůt podle § 242 odst. 3 nebo 4 zákona.

Námitky proti dobrovolnému oznámení o záměru uzavřít smlouvu podle § 212 odst. 2 zákona musí být doručeny Zadavateli do 30 dnů od uveřejnění tohoto oznámení.

Zadavatel je povinen námitky vyřídit do 15 dnů. Návrh je nutné doručit ÚOHS i Zadavateli do 10 dnů ode dne, v němž stěžovatel obdržel rozhodnutí, kterým Zadavatel námitky odmítnul nebo do 25 dnů od odeslání námitek, pokud Zadavatel o námitkách nerozhodl.

Po uzavření smlouvy na veřejnou zakázku či rámcové dohody lze podat pouze návrh na uložení zákazu plnění smlouvy, a to i bez předchozího podání námitek. Návrh na uložení zákazu plnění smlouvy doručí navrhovatel ÚOHS a ve stejnopisu Zadavateli do 30 dnů ode dne, kdy Zadavatel uveřejnil oznámení o uzavření smlouvy způsobem podle § 212 odst. 2 zákona s uvedením důvodu pro zadání veřejné zakázky bez uveřejnění oznámení o zahájení zadávacího řízení, předběžného oznámení nebo výzvy k podání nabídek ve zjednodušeném podlimitním řízení, nejpozději však do 6 měsíců od uzavření této smlouvy. Návrh na uložení zákazu plnění smlouvy podle § 254 odstavce 1 písm. d) zákona doručí navrhovatel ÚOHS a ve stejnopisu Zadavateli do 30 dnů ode dne, kdy Zadavatel uveřejnil oznámení o uzavření smlouvy na základě rámcové dohody podle § 137 zákona nebo oznámení o uzavření smlouvy v dynamickém nákupním systému podle § 142 zákona, nejpozději však do 6 měsíců od uzavření této smlouvy.

Ve lhůtě pro doručení návrhu je navrhovatel povinen složit na účet ÚOHS kauci ve výši 1 % z nabídkové ceny navrhovatele za celou dobu plnění veřejné zakázky nebo za dobu prvních čtyř let plnění v případě smluv na dobu neurčitou, nejméně však ve výši 50 000 Kč, nejvýše ve výši 10 000 000 Kč. V případě, že navrhovatel nemůže stanovit celkovou nabídkovou cenu, je povinen složit kauci ve výši 100 000 Kč. V případě návrhu na uložení zákazu plnění smlouvy je navrhovatel povinen složit kauci ve výši 200 000 Kč. Jde-li o řízení o přezkoumání postupu pro zadávání koncesí, je navrhovatel povinen ve lhůtě pro doručení návrhu složit na účet ÚOHS kauci ve výši 1 % z předpokládané hodnoty koncese uveřejněné ve Věstníku veřejných zakázek nebo na profilu Zadavatele, nejméně však ve výši 50 000 Kč, nejvýše ve výši 10 000 000 Kč. V případě, že Zadavatel neuveřejní ve Věstníku veřejných zakázek nebo na profilu Zadavatele předpokládanou hodnotu koncese, je navrhovatel povinen složit kauci ve výši 100 000 Kč. V případě návrhu na uložení zákazu plnění koncesní smlouvy je navrhovatel povinen složit kauci ve výši 200 000 Kč.